W odległym, ponurym świecie wybuchła wojna między ludźmi a zombie. Te potwory powstały z grobów zaatakowały miasto, w pobliżu którego znajdował się cmentarz. Bohater gry Skulls vs Zombies stanął w obronie ludności. Zbudował katapultę i rzucił zaklęcia na czaszki, które mógł znaleźć w lochach. Teraz, kiedy trafisz potwory, te czaszki niosą je na kawałki. Twoim zadaniem jest naładować katapultę, aby obliczyć trajektorię strzału. Gdy jesteś gotowy, aby wystrzelić pocisk na potwora. Jeśli zrobiłeś wszystko poprawnie, szarża trafi w cel i zniszczy wroga. Więc zniszczysz zombie.