W świecie pikseli rozpoczęła się poważna operacja antyterrorystyczna. Zajmie to najlepsze siły specjalne. W grze Pixel Warfare One będziesz mógł uczestniczyć w tym konflikcie wybierając dowolną ze stron. Jak tylko to zrobisz, twoja postać zostanie przeniesiona do specjalnej lokacji, w której będą miały miejsce walki. Musisz przez niego przejść, szukając swoich przeciwników. Gdy zostanie wykryty, otwórz ogień z karabinu maszynowego i zniszcz wszystkich rywali. Po śmierci możesz podnieść upuszczoną amunicję i broń.