Księżniczka Anna postanowiła pójść do miasta incognito i zobaczyć, jak żyją zwykli ludzie. Spacerując po mieście, postanowiła zejść do miejskiego metra. Ale problem polega na tym, że jeden z przestępców rozpoznał ją, a teraz, wraz ze swoimi wspólnikami, chce zostać złapany na żądanie okupu. W grze Subway Princess Run będziesz musiała pomóc księżniczce uciec od nich przez tunele metra. Twoja bohaterka przejdzie przez nie stopniowo, podnosząc prędkość i zbierając różne złote monety i inne przedmioty znajdujące się wszędzie. Musisz pomóc jej uniknąć kolizji z przeszkodami i przeskakiwać przez różne przeszkody.