Młody chłopak Tom jest naukowcem i dość często podróżuje po świecie. Nasz bohater szuka pozostałości starożytnych miast i je eksploruje. Ty w grze Boy Adventurer dołączasz do jego następnej przygody. Twój bohater będzie musiał przejść przez dżunglę do ruin starożytnej świątyni. Będzie musiał biec wzdłuż ścieżki, na której będzie wiele niebezpiecznych odcinków, a także ustawione zostaną różne pułapki. Ty, kontrolując działania swojego bohatera, będziesz musiał zmusić go do przeskoczenia nad nimi. Pomóż mu po drodze zbierać złote monety i inne przedmioty bonusowe.