Podróżując po odległych zakątkach naszej galaktyki, astronauta imieniem Tom odkrył nadającą się do zamieszkania planetę. Oczywiście postanowił ją zbadać. Po wylądowaniu na powierzchni planety na swoim statku nasz bohater wyszedł na jej powierzchnię i wyruszył w podróż. Ty w grze Aliens In Charge pomożesz mu w tej przygodzie. Twój bohater będzie musiał podążać określoną trasą i pokonać wiele przeszkód i pułapek znajdujących się na drodze. W takim przypadku będziesz musiał zebrać różne przedmioty rozrzucone na drodze. Jak się okazało, planetę zamieszkuje agresywna rasa obcych. Zaatakują cię, próbując cię zabić. Twój bohater będzie uzbrojony w broń palną. Po zauważeniu wroga będziesz musiał wycelować w niego wzrokiem swojej broni i oddać strzały. Jeśli masz celny celownik, to trafiające we wroga kule go niszczą i za to otrzymasz punkty. Pamiętaj, że jeśli nie masz czasu na reakcję w porę, wróg cię zaatakuje, a twoja postać zginie.