W czwartej części Super Mario Advance 4 będziesz kontynuować podróż z hydraulikiem Mario przez wspaniały świat, w którym się znalazł. Twój bohater będzie musiał przejść przez wiele lokacji i zebrać różnorodne przedmioty rozproszone wszędzie. Po drodze czekają na niego różne pułapki. Część z nich Twój bohater będzie musiał przeskoczyć, a część będzie mógł ominąć. Twój bohater natrafi także na potwory, które będą próbowały go zabić. Będziesz musiał to zrobić, aby twój bohater skoczył mu na głowę. W ten sposób zniszczy je i zdobędzie za to punkty.