Na jednej z odległych planet naukowcy odkryli wejście do starożytnego labiryntu. W Shy Eye Labyrinth: The Incredible Mystery będziesz musiał zinfiltrować i eksplorować. Sam labirynt składa się z kilku poziomów. Rozpoczniesz swoją podróż od samego początku. Aby dostać się na drugie piętro labiryntu, będziesz musiał znaleźć klucz, który będzie ukryty gdzieś w lochu. Będziesz musiał przejść przez loch i dokładnie wszystko zbadać. Po drodze natrafisz na różnego rodzaju pułapki, które będziesz musiał ominąć. Jeśli wpadniesz w pułapkę, zginiesz i zakończysz misję.