W Fruit Doctor, jako lekarz, udasz się do magicznego królestwa, w którym obok ludzi żyją różne owoce. Będziesz pracować w szpitalu, który leczy te niesamowite stworzenia. Przed Tobą na ekranie zobaczysz swój gabinet, w którym pacjent będzie leżał na stole. Może to być dowolny owoc. Aby rozpocząć leczenie, musisz go zdiagnozować. Jeśli masz jakiekolwiek trudności w grze, dostępna jest pomoc, która w formie podpowiedzi wskaże ci kolejność działań. Po ich wykonaniu możesz wyleczyć swojego pacjenta i przejść na wyższy poziom gry.