Chomik o imieniu Tom mieszka w laboratorium naukowym. Pomaga naukowcom badać ich gatunki. Dziś będzie musiał wykonać szereg zadań związanych z przechodzeniem różnych labiryntów. Ty w grze Hamster Stack Maze będziesz musiał pomóc chomikowi w wykonaniu wszystkich zadań. Przed tobą na ekranie będzie widoczna twoja postać, która będzie przy wejściu do labiryntu. Za pomocą klawiszy sterujących pokierujesz jego działaniami. Będziesz musiał skierować chomika w określonym kierunku i poszukać wyjścia z labiryntu. Po drodze twój bohater będzie musiał pokonać różnego rodzaju pułapki i przeszkody, a także zbierać porozrzucane wszędzie przedmioty. Za każdy podniesiony przedmiot otrzymasz punkty.