Ellie the Fairy i Ronald the Dwarf wrócili do swojej rodzinnej wioski Greenhill po krótkiej nieobecności w The Mystery of Greenhill. Dosłownie dzień wcześniej poszli do lasu po zioła, a kiedy wrócili, zastali wszystkie domy i ulice puste. Wydaje się, że ludzie zniknęli naraz. W niektórych domach na piecu gotowano jedzenie, jakby gospodyni wyszła na chwilę. Psy szczekały wściekle, krowy muczały, a koty kuliły się pod ławkami. Wygląda na to, że działa tu czarna magia. Bohaterowie są zdezorientowani, ale potem postanawiają dowiedzieć się, co się stało. Aby to zrobić, muszą wszystko dokładnie zbadać i poszukać przynajmniej niektórych dowodów. Z pewnością coś musi pozostać i wskazać, co mogło to zrobić w Tajemnicy Greenhilla.
