W świecie pikseli rozpoczęła się wojna między dwoma sąsiednimi państwami. Dołączysz do tej konfrontacji w grze Pixel Gunner i pomożesz swojemu bohaterowi przetrwać i zniszczyć jak najwięcej przeciwników. Twoja postać będzie widoczna na ekranie przed tobą, która będzie w określonym obszarze z bronią w rękach. Znajdzie się w nim również jego przeciwników. Będziesz musiał sprowadzić do nich bohatera na pewną odległość, a następnie po złapaniu wroga w lunetę otworzyć ogień. Strzelając celnie, zniszczysz przeciwników i zdobędziesz za to określoną liczbę punktów w grze Pixel Gunner.