Postanowiono odrestaurować stary opuszczony budynek szpitala, pomimo ostrzeżeń weteranów, że będzie to stanowić zagrożenie dla pracowników. Według lokalnej legendy w Lets Kill Evil Nun wydarzyło się tu coś strasznego i od wielu lat rozwścieczony duch zakonnicy przechadza się korytarzami i komnatami w poszukiwaniu ofiary. Nikt nie odważy się wejść do wnętrza budynku, a ci, którzy się odważą, nigdy nie wracają. Burmistrz nie wierzy jednak w bajki i postanawia je naprawić, jednak pod presją opinii publicznej postanowiono zaprosić nadprzyrodzonego myśliwego, aby sprawdził obecność ducha i uspokoił go własnymi metodami. W grze Lets Kill Evil Nun staniesz się tym samym myśliwym.