Ludzie chorują i nie ma od tego ucieczki, dlatego farmakolodzy pracują niestrudzenie, a lekarze wpychają pacjentom pigułki. W grze Pill Puzzler również dołączysz do tego ciągłego procesu i najpierw musisz przygotować pigułki, aby mieć czym nakarmić pacjentów. Wejdź do laboratorium, a na tacy pojawią się wielokolorowe tabletki. Musisz rozmieścić je w pudełkach w minimalnej liczbie ruchów, a następnie udać się do szpitala, aby przyjąć pacjentów. Daj każdemu to, co mu przepisano i szybko, nie chce czekać. Za uzyskane środki możesz wyposażyć gabinet lekarski w Pill Puzzler.
