Armia Toalet Skibidi zaatakowała dużą metropolię i było to całkowitym zaskoczeniem. Przez dość długi czas nikt nie słyszał o tych mutantach. Byli wielokrotnie pokonani i wyrzuceni ze świata, a nawet armię wywożono z dużych miast i przekierowywano do baz wojskowych. Najwyraźniej toaletowe potwory operują inteligencją na bardzo wysokim poziomie, dlatego wysłali swoich wojowników w czasie, gdy nie było nikogo, kto mógłby chronić populację. Dlatego w grze Skibidi Ninja będziesz z nimi walczyć. Twój bohater będzie uzbrojony w miecz, ale włada nim po mistrzowsku. Przed tobą na ekranie zobaczysz lokalizację, w której pojawią się toalety Skibidi poruszające się z różną prędkością. Będziesz musiał wybrać cele i zadać im niszczycielskie ciosy. Można to zrobić za pomocą myszy. Wyobraź sobie, jak zadajesz tnący cios i machasz toaletowym potworem, przytrzymując lewy przycisk. W ten sposób potniesz toalety Skibidi na kawałki i zdobędziesz za to punkty w grze Skibidi Ninja. Uważaj, wśród przeciwników mogą znajdować się bomby. Pod żadnym pozorem nie należy ich dotykać. Jeśli dotkniesz chociaż jednej bomby, nastąpi eksplozja i przegrasz rundę. Nie masz zbyt wielu prób ukończenia misji, dlatego ważne jest, aby zachować ostrożność i nie popełniać błędów.