W stolicy planety, w której osiedlili się transformatorzy, zaatakowali desiptykonów. Ich statki kosmiczne unosiły się nad planetą i upuszczały żołnierzy z robotów. Jesteś w grze Transformers Robots in Disguise: Protect Crown City będzie musiał pomóc Bumblebee i jego przyjaciołom chronić kapitał przed inwazją. Najpierw wybierz postać, którą będziesz grać. Wszystkie mają swoją własną charakterystykę. Wtedy znajdziesz się w mieście, a zobaczysz zstąpienie desepticonów z nieba. Będziesz musiał strzelać do nich specjalną bronią energetyczną, jeśli trafisz wroga, zamknie go w kokonie. Przemieniasz bohatera w samochód, który będzie musiał je zebrać.