Obcy z równoległego świata zaatakowali jedną z planet w świecie pikseli. Pojawiają się z portalu znajdującego się w powietrzu i zaczynają tworzyć formacje bojowe. Siły powietrzne planety zostały zaalarmowane. W grze Pixel War będziecie służyć jako pilot myśliwski. Musisz lecieć na swój statek, aby spotkać wroga i dołączyć do bitwy. Zręcznie manewrując na statku, wystrzelisz z broni i zniszczysz wszystkich rywali. Im więcej ich zabijesz, tym więcej punktów otrzymasz.