Świat pikseli pochłonął okrutną apokalipsę. Mieszkańcy dzielą się na kilka obozów, które nieustannie walczą między sobą. Ponadto byli zombie i mutanci gotowi pożreć każdego. Po wejściu do gry Pixel Apocalypse: New Adventure pierwszą rzeczą, którą musisz wybrać, jest lokalizacja. Może być już zakończone lub sam go utworzysz. Następnie musisz wybrać swój status. Możesz zostać żołnierzem, a nawet zombie. W zależności od tego Twoje możliwości zostaną określone. Umarli nie potrzebują broni, szybko się poruszają i sprawnie kontrolują swoje zęby i ręce. Żołnierz będzie potrzebował broni, a znajdziesz ją lub kupisz, gdy zdobędziesz pieniądze na trofeum.