W nowej grze Mr Ninja Fighter udasz się do starożytnej Japonii i pomożesz dzielnej wojnie ninja walczyć z gangami rabusiów. Twoja postać będzie musiała udać się do odległych prowincji kraju i zniszczyć wszystkie gangi przestępców. Przed tobą na ekranie będzie widoczna twoja postać uzbrojona w miecz. Pobiegnie naprzód ścieżką. Po drodze spadną różne spadki na ziemię i pułapki. Będziesz musiał użyć klawiszy kontrolnych, aby Twoja postać przeskoczyła nad nimi wszystkimi. Spotkając się z wrogiem, uderz go mieczem i zniszcz wroga.