Młody archeolog o imieniu Tom odkrył opuszczoną świątynię Majów w dziczy amazońskiej dżungli. Nasz bohater postanowił zinfiltrować jego terytorium i zbadać wszystko dookoła. Ty w grze The Mayan Menace pomożesz mu w tej przygodzie. Za pomocą klawiszy sterujących powiesz swojej postaci, w którym kierunku będzie musiał się poruszać. Po drodze powstaną pułapki, które będziesz musiał ominąć. Pamiętaj też, że świątynia jest chroniona przez martwe zombie Majów. Musisz z nimi walczyć. Z pomocą swojej broni zniszczysz wroga i zdobędziesz za to punkty. Jeśli z zombie wypadną trofea, będziesz musiał je wszystkie zebrać.