Mario i cały jego świat muszą zostać pilnie uratowani, a ty zajmiesz się tym w grze Super Mario Bubble Shoot. W tym przypadku będziesz musiał zająć się ratowaniem nie tylko samego hydraulika, jego brata Luigiego, ukochanego dinozaura, księżniczki Peach, ale nawet samego Bowsera i wszystkich jego popleczników: złych grzybów i ślimaków. Świat nie będzie kompletny, jeśli nie zostaną w nim żadne negatywne postacie. Jak ustalić, czy jest dobry, jeśli nie ma tych, którzy się temu sprzeciwiają. Twoim zadaniem jest zestrzelenie bąbelków i uniemożliwienie im dotarcia do dołu ekranu, a zwłaszcza przekroczenia czerwonej linii. Strzelaj do tych samych kulek, zbierając trzy lub więcej identycznych baniek obok siebie i sprawiając, że spadają w Super Mario Bubble Shoot.