Bieganie po torach do gry już dawno przestało być tradycyjne, czasem biegają na piętach, czasem z kijkiem, czasem po schodach, a gra Balance Run 3D poszła jeszcze dalej. Nasz bohater będzie poruszał się po planszy, która znajduje się na dwóch słupkach klocków. Aby pokonać wszystkie przeszkody, musisz po drodze zbierać żółte klocki, ale należy zachować równowagę. Jeśli lewy lub prawy słupek będzie znacznie niżej, plansza za bardzo się przechyli, a bohater po prostu się ześlizgnie, a gra Balance Run 3D dobiegnie końca. Poziomy stają się coraz trudniejsze, ale na pewno.