Tajny agent o kryptonimie # 46 będzie musiał dziś wykonać szereg misji na całym świecie. Ty w grze Super Spy Agent 46 pomożesz mu w tym. Wybierając misję znajdziesz się w określonym obszarze. Używając klawiszy sterujących, sprawisz, że twój bohater będzie poruszał się do przodu. Rozejrzyj się uważnie. Gdy tylko zauważysz wroga, wyceluj w niego broń i złap go w lunetę. Gdy będziesz gotowy, otwórz ogień, aby zabić. Strzelając celnie zabijesz wrogów. Za to otrzymasz punkty. Po śmierci wroga mogą z niego wypaść trofea. Będziesz musiał zebrać te przedmioty. Pomogą Twojemu bohaterowi przetrwać i wygrywać kolejne bitwy.