Mario nie jest entuzjastycznie nastawiony do Halloween, ponieważ zwykle w tym czasie wszystkie złe duchy są aktywowane w przestrzeniach Królestwa Grzybów, a Bowser wypuszcza wszystkich swoich sługusów, aby zrobić bałagan. W Super Mario Flash Halloween Version pomożesz Mario znaleźć wszystkich złoczyńców i wykończyć ich, skacząc z góry. Wszyscy przyjaciele bohatera, a nawet brat Luigiego chowają się w domu i nie wytykają nosa, tylko dzielny hydraulik nikogo się nie boi. I jest ku temu powód - to ty, zwinny gracz, będziesz kontrolował bohatera i nie pozwoli mu popełnić błędu w Super Mario Flash Halloween Version.
