Owoce w Fruit Ninja nie są przeznaczone do jedzenia jako sałatki lub po prostu dla zabawy. Pęczek owoców zebrał bohater gry ninja, aby nie stracić umiejętności posługiwania się mieczem katana. Bohater pracuje jako kucharz w kawiarni, kilka lat temu opuścił ojczyznę nie z własnej woli, lecz ukrywając się przed lokalną mafią. Ale ręce mafii są długie i mogą go znaleźć w każdej chwili, co oznacza, że musisz być przygotowany i wymagane jest szkolenie. A ponieważ nie ma pod ręką specjalnego sprzętu sportowego, będziesz musiał użyć owoców. Asystent podrzuci arbuzy, banany, jabłka, kiwi i inne owoce, a Ty pokroisz je we Fruit Ninja.
