Istnieją tak zwane latające ryby, ale nie szybują po niebie jak ptaki, lecz mogą wyskoczyć z wody tylko na krótki czas. Bohaterką gry Flappy Fish jest zwykła rybka-klaun, która znajduje się w trudnej sytuacji. Zdecydowała się zmienić radiestezję, ponieważ tam, gdzie wcześniej mieszkała, było znacznie gorzej. Woda jest zatkana, podwodne rośliny nie rozwijają się, wszystko umiera, a znalezienie pożywienia jest coraz trudniejsze. Zmusiło to ryby do wyruszenia w poszukiwaniu lepszego życia. Ale po drodze pojawiały się straszne przeszkody w postaci kotwic z łańcuchami. Biedak nigdy wcześniej nie widział czegoś takiego. Będziesz musiał przejść tędy pomiędzy ostrymi kotwicami i musisz pomóc rybom w Flappy Fish.
