Po serii niepowodzeń na Skibidi Land, toalety zdecydowały się zastosować w grze Skibidi Strike nową taktykę. W rezultacie postanowili wejść w przestępczy spisek z terrorystami i zjednoczyć się z nimi pod wspólnymi sztandarami. Przestępcy wyszli im naprzeciw, nie spodziewając się, że sami staną się tymi samymi toaletowymi potworami. Niemniej jednak Skibidi znajdują się w jednej z baz na środku pustyni i teraz jako część grupy sił specjalnych udasz się tam, aby ich wyeliminować. Przede wszystkim musisz wybrać amunicję i broń dla swojego bohatera. Następnie udasz się do szturmu na bazę. Musisz potajemnie poruszać się po terytorium, w tym celu możesz użyć różnych budynków, skrzynek i innych obiektów. Gdy tylko w twoim polu widzenia pojawią się potwory, wyceluj i otwórz do nich ogień. Za każdego zabitego wroga otrzymasz określoną liczbę punktów, które możesz wykorzystać do uzupełnienia amunicji i ulepszenia swojej broni. Przestępcy mogą także podrzucić różne przydatne bonusy i apteczki, które pomogą Ci przywrócić zdrowie Twojemu bohaterowi. Gdy tylko oczyścisz całkowicie określoną lokalizację, możesz przejść do następnego poziomu gry Skibidi Strike.
