Jest to kult, gdzie młodzi chłopcy uczą się sztuki ninja. Jest to bardzo trudna droga, która wymaga nie tylko dobrego przygotowania fizycznego, ale także hartu ducha. Do przestrzegania wszystkich przepisów prawnych ninja kodu, nie każdy może. Ninja Boy gra, zostanie wprowadzony do Kuhn, chłopca, który postanowił poświęcić swoje życie kodeksu ninja. Wczoraj został zaatakowany w jego szkole. Napastnicy nie są ludzie, a niektóre bardzo dziwne potwory. Ukradli wszystkie skarby szkoły ninja. Teraz tylko Kun może odzyskać skradzione, ale on potrzebuje twojej pomocy. Musisz poprowadzić go tak, że on, przy minimalnej liczbie ruchów, zabijać potwory i skarby zwrócone.