Naruto Uzumaki, Sakse Uchiha i Sensei Kakashi to znane postacie dla tych, którym nie brakuje przygód Naruto i jego przyjaciół. Spotkasz wszystkich trzech w grze Naruto Free Fight i pomożesz pokonać prawdziwą armię zła. Ich drużyna może być niewielka, ale każdy ma spore umiejętności w sztuce walki wręcz. Nawet sam Naruto będzie w stanie pokazać, do czego jest zdolny pod twoim zręcznym przewodnictwem. Możesz jednak wybrać dowolną postać. Ponadto na każdym poziomie konieczne jest odzwierciedlenie ataków określonej liczby wrogów. Jeśli wciśniesz klawisz X, bohater zacznie walczyć nogami. Klawisz Z do zestawów do pracy rękami, podnosić z ziemi różne bronie upuszczone przez wrogów i używać ich przeciwko nim w Naruto Free Fight.