Zazwyczaj świat gry jest lojalny wobec każdego, kto chce nauczyć się latać i próbuje swoich sił w lataniu. Ale w Flappy Annihilation 2 wszystko będzie zupełnie odwrotnie. Zbudowałeś specjalny anihilator, którego zadaniem jest nie przegapić ani jednej latającej istoty. Dwie potężne kolumny, jedna u dołu, a druga u góry, po dotknięciu ekranu zbiegają się i łączą z potężnym dźwiękiem. Wszystko, co stanie między nimi, zamienia się w krwawe mielone mięso. Twoim zadaniem jest recykling wszystkich kurczaków, które wyobrażały sobie, że są latającymi ptakami. To będzie ich ostatni lot. Jeśli przegapisz trzy kurczaki, gra się zakończy, a twoje punkty w Flappy Annihilation 2 zostaną zapamiętane na zawsze.