Oprócz codziennych zmian w mieście, Spider-Man ma tajne misje, aby kontrolować spokój mieszkańców. Członkowie rządu i różnych organów. Kraje związane z bezpieczeństwem. Zwracają się do super bohatera o pomoc w szczególnie trudnych i ważnych sprawach, w których zwykli ludzie nie radzą sobie. W grze Spider-man vs Robot znajdziesz bohatera wykonującego właśnie taką specjalną misję. Musi zinfiltrować tajną bazę, w której osiedlili się terroryści na skalę światową i ją zniszczyć. Ale podejścia do bazy są pilnie strzeżone i bohater będzie musiał stawić czoła całej hordzie robotów i zombie w Spider-man vs Robot.