Wysoko w górach w świecie Minecrafta znajduje się świątynia, w której szkoli się wojowników ninja. Niegdyś najechali go żołnierze gwardii królewskiej. Ty w grze Noob Ninja Guardian będziesz musiał pomóc swojemu bohaterowi chronić świątynię przed żołnierzami. Określona lokalizacja, w której będzie znajdować się twoja postać, będzie widoczna na ekranie przed tobą. W jego kierunku ruszą żołnierze wrogiej armii. Używasz myszki do kontrolowania działań swojego bohatera. Będziesz musiał atakować przeciwników. Zadając serię ciosów i kopnięć zniszczysz wroga i zdobędziesz za niego punkty. Z każdym poziomem przeciwników będzie coraz więcej. Dlatego uważnie rozglądaj się i zbieraj bronie, które pojawią się w lokacji. Dzięki niemu szybko i sprawnie zniszczysz wrogów.