Sonic nie tylko biegnie szybko, bohater postanowił spróbować szczęścia w locie i jego próba może być śmiertelna, jeśli nie pomożesz jeżowi w Flappy Sonic. Konieczne jest kliknięcie na postać, aby zmienić wysokość lotu. Jest to konieczne, w przeciwnym razie nie będzie mógł przelecieć między rurami wystającymi zarówno z dołu, jak iz góry, a między nimi jest tylko mały pusty otwór, do którego trzeba się prześlizgnąć i nie uderzać w nie. Bądź zwinny i zwinny, aby Sonic nie zderzył się z inną rurą w Flappy Sonic.