Gdy tylko w naszym wirtualnym mieście pojawiają się niechciane osobowości, które szkodzą miastu i jego mieszkańcom, mieszkańcy zaczynają wybierać bohatera, który mógłby oprzeć się złoczyńcom. Tym razem na ulicach miasta pojawiły się potwory ze Stowarzyszenia Potworów, które powstało wbrew Stowarzyszenia Bohaterów. Tylko Saitama lub Bald Cloak, znany również jako One Punch Man lub One Punch Man, mogą sobie z nimi poradzić. Ale musisz mu pomóc w grze One Punch Man 3D, ponieważ będzie wielu wrogów i najpierw musisz ich znaleźć w dużym mieście. W prawym górnym rogu znajdziesz nawigatora z czerwonymi kropkami - to cele bohatera w grze One Punch Man 3D.