Najróżniejsze wszechświaty, jeden po drugim, zostają przejęte przez potwory z toalet Skibidi. Mario uważnie śledzi wiadomości i rozumie, że prędzej czy później dotrą do Grzybowego Królestwa. Postanowił temu zapobiec i udał się na przechwycone światy, aby zniszczyć tamtejszych złoczyńców. Zdecydował się na to nie bez powodu, nasz bohater długo służył w wywiadzie, chociaż niewiele osób o tym wie, a posiada wszystkie niezbędne umiejętności. Bohater znajdzie się na terytorium zajętym przez potwory Skibidi. Hydraulik ze zdolnościami szpiegowskimi musi zbadać okolicę i postarać się, aby wszystko było jak najciszej. Nie da się jednak osiągnąć całkowitej ciszy. Kontroluj jego ruchy za pomocą strzałek. Po drodze będą przeszkody, które będziesz musiał przeskoczyć. Kolizje są nieuniknione i warto się na nie przygotować odpowiednio wcześniej, aby móc atakować z najdogodniejszej pozycji. Twój nie będzie mógł używać broni, ponieważ głośne strzały zwrócą niepotrzebną uwagę na jego osobę. Weź udział w walce wręcz z wrogiem, uderz klawiszem Z i ruszaj do przodu w grze Super Spy Mario VS Skibidi Toilet. Każdy ukończony poziom zostanie nagrodzony i będziesz mógł wzmocnić Mario.