W Brain Bloxx wprowadzono nową łamigłówkę z blokami kolorów. Obejmuje dwa rodzaje figurek blokowych: czerwony i żółty. Zadanie polega na ułożeniu jak największej liczby figurek o różnych kształtach na małym kwadratowym polu. W tym przypadku obstawiasz kolor czerwony na żółty i odwrotnie. Postać musi całkowicie wstać, jeśli nie pasuje, w miejscach, w których nie pasuje, zobaczysz zielone paski, co jest niedopuszczalne. Gra Brain Bloxx zakończy się, jeśli nie będzie już miejsc na umieszczenie elementów. Zdobądź maksymalną liczbę punktów i aby to zrobić, rozmieszczaj elementy racjonalnie, myśląc przyszłościowo.