Fabryka produkcji animatroników jest już od dawna zamknięta, ale kilkunastu strażników już tam zniknęło i trzeba coś z tym zrobić. Postanowiono zamknąć fabrykę, szczelnie ją uszczelniając. Ale najpierw musisz posprzątać, niszcząc pozostałości animatroniki, jeśli takie istnieją. W grze FNAF Shooter uzbroisz się w dwa pistolety jednocześnie i udasz się do warsztatów. Czeka na Ciebie niespodzianka: okazuje się, że złych zabawek jest jeszcze więcej niż przed zamknięciem fabryki. Przez cały ten czas potajemnie ustanowiły samoreprodukcję i na każdym poziomie animatroniki będą wyskakiwać przed tobą jedna po drugiej. A ty po prostu masz czas, żeby je zastrzelić w FNAF Shooter.