Ninja uczył się długo i wreszcie nadszedł czas, aby wykorzystać swoją wiedzę i umiejętności w Dark Ninja Hanjo. Sensei poinformował swojego ucznia, że jest gotowy na rozpoczęcie samodzielnego życia, ale jednocześnie były uczeń został poproszony o wykonanie bardzo ważnej misji polegającej na przywróceniu miasta. Misja pokaże, jak przygotowany jest bohater. Miasto jest pochłonięte przez ciemność; aby je uwolnić, będziesz musiał walczyć z demonami lub opętanymi wojownikami. Ninja będzie mógł pokazać, do czego jest zdolny. Otrzymuj instrukcje od nauczyciela; na początkowym etapie będzie on towarzyszył swojemu uczniowi, ale potem musisz działać samodzielnie w Dark Ninja Hanjo.
