Gra Ant vs Cookie oferuje dwa tryby gry: poziomy i nieskończony. W pierwszym trybie zostajemy poproszeni o przejście sześćdziesięciu poziomów, wykonując przydzielone zadania. Ich istotą jest niszczenie mrówek, które próbują dostać się do leżących w trawie ciasteczek. Klikając na owady, zniszczysz je, wypełniając skalę u góry ekranu. Gdy się zapełni, przejdziesz do następnego poziomu. W trybie nieskończonym musisz po prostu chronić pliki cookie tak długo, jak to możliwe, przed inwazją mrówek wszystkich typów i kolorów w grze Ant vs Cookie.